一、受理审核。
（一）主管税务机关应根据此下四种情况审核购买方或销售方填报的《开具红字增值税专用发票申请单》以及书面材料： 1.因专用发票抵扣联、发票联均无法认证的，审核购买方填报的《开具红字增值税专用发票申请单》中填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息；2.购买方所购货物不属于增值税扣税项目范围，取得的专用发票未经认证的，由购买方填报《开具红字增值税专用发票申请单》中填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息；3.因开票有误购买方拒收专用发票的，销售方向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》的，主管税务机关应审核《开具红字增值税专用发票申请单》中销售方填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息，同时审核购买方提供的书面材料；4.因开票有误等原因尚未将专用发票交付购买方的，销售方向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》的，主管税务机关应审核《开具红字增值税专用发票申请单》中销售方填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息，同时审核销售方提供的书面材料。
（二）审核发现报送的资料不完整不齐全，存在疑点，未按照规定加盖印章，或者填写内容不符合规定等情况应当场一次性告知纳税人补正。
二、核准。审核无误的，主管税务机关出具《开具红字增值税专用发票通知单》，税务机关为小规模纳税人代开专用发票需要开具红字专用发票的，比照一般纳税人开具红字专用发票的处理办法，《开具红字增值税专用发票通知单》第二联交代开税务机关。
三、资料归档。
（一）主管税务机关应根据此下四种情况审核购买方或销售方填报的《开具红字增值税专用发票申请单》以及书面材料： 1.因专用发票抵扣联、发票联均无法认证的，审核购买方填报的《开具红字增值税专用发票申请单》中填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息；2.购买方所购货物不属于增值税扣税项目范围，取得的专用发票未经认证的，由购买方填报《开具红字增值税专用发票申请单》中填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息；3.因开票有误购买方拒收专用发票的，销售方向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》的，主管税务机关应审核《开具红字增值税专用发票申请单》中销售方填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息，同时审核购买方提供的书面材料；4.因开票有误等原因尚未将专用发票交付购买方的，销售方向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》的，主管税务机关应审核《开具红字增值税专用发票申请单》中销售方填写的具体原因以及相对应的蓝字专用发票信息，同时审核销售方提供的书面材料。
（二）审核发现报送的资料不完整不齐全，存在疑点，未按照规定加盖印章，或者填写内容不符合规定等情况应当场一次性告知纳税人补正。
二、核准。审核无误的，主管税务机关出具《开具红字增值税专用发票通知单》，税务机关为小规模纳税人代开专用发票需要开具红字专用发票的，比照一般纳税人开具红字专用发票的处理办法，《开具红字增值税专用发票通知单》第二联交代开税务机关。
三、资料归档。