而到了金正日时代，他开始被委以重任，担任朝鲜劳动党组织指导部第一副部长，要知道这个部门可不简单，部长为最高指导者金正日亲自兼任，该部也是朝鲜所有部门中权力名列第一的部门，甚至可以掌控别的部门生死。在朝鲜的政治序列中组织指导部是处于权力最中心的部门。此刻的他一时风光无两，甚至传言他当时连死人都能救活，比如某个犯了大罪的人，只要他帮着说话，就可以免除罪过。到了2005年他却突然被撤职，据说是金日成的秘书汇报给金正日，张成泽一些不好的传闻所致，比如有一些证据指向他不仅贪财还好色，而张成泽得知后竟然动用了一些手段导致该秘书被迫害致死。金正日听说此事，大发雷霆，张成泽被撤职赋闲了好一段时间，但是人身安全没有危险。
几年后，金正日突发中风导致身体每况愈下，且朝鲜也已经来到权力交接的关口，张成泽再次被启用，这次他担任行政部部长，国防委员会副委员长，授予大将军衔。在金正日的葬礼上，他紧紧跟随在金正恩的身后，此刻张成泽无疑已经成为了事实上的朝鲜二号人物。为什么短短两年后他就突然失势而被处刑呢？
关于这个事情一直以来有多种说法，其中有一种为金正日年轻时期和大他6岁的朝鲜电影演员成慧琳生下了金正男，由于金正日害怕金日成得知这个消息所以金正男的身份一直以来都是保密状态，在很多时候金正男由张成泽和金敬姬夫妇帮忙照顾，所以金正男从小和张成泽家关系特别好，在金正恩继承之后，张成泽和金正男仍然维持着非常好的关系，比如身在海外的金正男如果缺钱会联系张成泽，而张成泽也会派自己的心腹给他送钱。这导致了身为最高指导者的侄子的怨恨，认为他没有对自己彻底的进行忠诚的辅佐。
金正日后来和高英姬组建了新的家庭，生下了金正哲，金正恩，金与正三人，他们从小父母一直陪伴在身边，自然没有张成泽照顾过金正男的情况出现。而生了两个儿子一个女儿的高英姬本来可以抬头挺胸的生活，金正日也想带他们一家去见金日成元帅，但是被张成泽夫妻所阻止，因为他说当年金日成得知了金正男的存在对自己有了家庭还生了正男的金正日将军大发雷霆，他让将军好好想一想这种情况，称这会让大元帅生气和失望，由于他的劝阻高英姬母子4人没有见过金日成大元帅，而金正恩也变成了没有和爷爷合过影的孙子。所以有人猜测高英姬和张成泽夫妇的关系不好，而她也将这份情绪传递给了年幼的儿子。他可能从小就有所憎恨自己的姑父。
还有一种说法说明了事情发生的直接导火索。金正恩执政后，张成泽行使着自己的经济大权，很多部门的经济都由他负责，其中有一个位于平安南道的南浦水产养殖所，边上有一个空军基地。2013年秋天，金正恩前去视察，他发现该空军基地的情况糟糕透顶，不要说日常的训练了，就连供应食物的情况都满足不了，他就问该基地指挥官，怎么样才能解决这个问题，指挥官回答，如果把南浦水产养殖所交给我们来运营就可以解决这个情况。金正恩立刻下令把南浦水产养殖所移交给该空军基地后，就离开了这里。然而就是这个命令，直接导致了后续一系列问题的爆发，他虽然下了命令但是他不知道的是，该养殖所为张成泽下辖第五十四部所拥有，部长为张成泽的心腹张秀吉。该部所设立的初衷是为了完成金正日将军在2000年代末期提出的在平壤建设10万户住宅而服务。五十四部赚到的钱都交给张成泽来负责10万住宅建设了，为此南浦水产养殖所和中国公司签有合同，每年提供一百多万美元的水产。如果移交给空军，那么合约会作废，并且将影响到住宅建设计划。
就在空军基地派人去接手南浦水产养殖所的时候，张秀吉得知情况也去了现场，他和军队的人说：请稍等，我去平壤翻转命令。在场的军官好像发现了什么不得了的事情，因为他发现了一个可以在最高司令官面前表现的大好机会。立刻向金正恩报告，五十四部部长张秀吉说要颠覆最高司令官的命令。
实际上以前这种情况也有例可循，以前如果出现指导者的要求不符合实际情况就会再次提出请求，以取得再次的指示。比如当年金正日曾经指示朝鲜外务省停靠在南浦港口的外来船只收保管费，但是外务省在实际执行过程中发现并不可行，因为有一些船是向朝鲜提供援助物资的，这样不好收保管费，于是提出建议，金正日下令，人道主义物资不需要收费。军队一看，外务省的船不要收费，就以为军队服务的船只收税会影响战争准备为由也取得了再次指示，这个计划最后不了了之了。张秀吉说的翻转就是这个意思。
张秀吉回到平壤后就把情况对张成泽做了汇报，请他出面获取再次指示。而他离开后不久就立即被保卫部的人抓捕，事态最终扩大为张成泽和心腹在密谋些什么阴谋，最高司令官本就对张成泽不满的心态彻底爆发了。最终酿成了肃清事件的起始点。事发前张成泽和金敬姬已经分居多年，由于2006年他们唯一的女儿在法国因为父母的管教自杀身亡后，两人不断发生争吵都认为对方是导致这个问题的推手，关系已经大不如前。加上张成泽的一些风流传闻，导致了金敬姬在事发前和张成泽实际上已经处于长久不联系状态，在处刑前，金正恩下令，金敬姬和张成泽离婚。