1、药物灭蛆法：使用常见的各种杀虫剂消杀。如敌百虫：0.5~1%敌百虫水溶液，倍硫磷：0.5%乳剂，二嗪哝（地亚农）：0.05～0.1%乳剂，灭幼脲：0.0125~0.025％悬浮剂，对厕所进行喷洒，灭蛆效果较好。
2、植物灭蛆法：苦楝树是农村常见的树木，枝繁叶茂树冠硕大，其枝叶有一定毒性，可以起到消灭蛆虫的作用，将苦楝树枝叶弄碎之后，扔到茅厕中，能够很好防治蛆虫。
3、生石灰灭蛆法：生石灰不仅能够防治蛆虫，而且可以吸收潮气和一些有害气体，改善厕所环境，是一种比较简单有效和经济实惠的方法。
4、柴草灰灭蛆法：农村烧火做饭的柴草灰，其实也可以很好防范蛆虫，因为柴草灰可以保持干燥，并且起到封闭的作用，因此一定程度上也能够消灭蛆虫。
5、 物理灭蛆法：及时把厕所内的粪便清掏干净，依靠堆肥发酵产生的热及有害气体，杀死粪肥中的蛆、蛹及寄生虫卵。